Um ein kontinuierlich hohes Qualitätsniveau zu gewährleisten, verfügt Haberfellner über ein eigenes, voll ausgestattetes Mühlenlabor für eine lückenlose Rohstoff und Endproduktkontrolle. 

Einwandfreies Getreide sowie geprüfte Rohstoffqualitäten sind die Voraussetzung für beste Mehle und Mehlmischungen. Bereits bei der Anlieferung des Getreides wird von jeder Lieferung mittels eines automatischen Probenehmers ein genau definiertes Durchschnittsmuster entnommen, das anschließend im Betriebslabor mit hochwertigen Analysegeräten genauestens untersucht wird. Basierend darauf werden Rohstofflieferungen qualitativ eingestuft. Dieses Muster wird als versiegeltes Rückstellmuster 2 Jahre lang aufbewahrt, um die Rückverfolgbarkeit zu gewährleisten. Der hohe Qualitätslevel wird durch zahlreiche internationale Zertifikate belegt.